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Recherche en antibiothérapie et antifongique
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Cette unité de recherche en antibiothérapie inclus des biochimistes des bactériologistes et des biologistes moléculaires capables de réaliser des études in vitro et in vivo. Cette unité travaillerait en lien étroit avec les unités de production de protéines, du
screening, de protéomique, et de chimie médicinale, telles que décrites plus loin. Par ailleurs, les besoins mondiaux et patents dans le domaine de la parasitologie étant considérables, il devra probablement être monté une structure susceptible de se focaliser dans ce domaine.
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Recherche dans le domaines des maladies orphelines ou négligées
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Sous la forme de collaborations étroites avec la recherche académique, et à l'intérieur d'une structure mixte "Nereis / instituts publics", il est souhaitable qu'une telle entité voit le jour. Les compétences de certaines plates-formes technologiques pourraient s'investir dans ce type de recherches (chimie combinatoire, HTS…). |
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Le rôle de cet ensemble est la découverte de nouvelles cibles thérapeutiques, l'identification de têtes de série et de mécanismes d'action possibles ainsi que l'optimisation rapide de ces têtes de série en médicaments innovants. Cette unité doit travailler en étroite collaboration et en continuité avec, d'un coté des unités de recherche, et de l'autre l'ensemble des unités de développement pré-clinique. Ses forces principales sont dans la chimie médicinale, le développement chimique, la production de protéines et la cristallographie, la synthèse et l'analyse de produits naturels ainsi que le HTS. Les différents laboratoires composant cette unité pourraient en outre travailler, dans le cadre de contrats spécifiques, pour des entreprises extérieures. Elle se divise en : |
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| Unité de chimie médicinale | Objectif : recherche de hits, molécules représentatives d'une série chimique et dont l'activité est en accord avec le TPP (target product profile), puis (après généralement un an) de leads, molécules d'activité moyenne, mais encore améliorable, afin d'obtenir (après généralement 16-18 mois) un EDC, susceptible d'entrer dans les phases d'étude pré cliniques. |
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| Susceptible d'alimenter le HTS; celle-ci participe à la découverte de hits. Via la connaissance des récepteurs, d'homologie de structure, de mécanismes d'action ou des protéines cibles, son bon fonctionnement permet la synthèse annuelle de plusieurs milliers de molécules ciblées |
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Objectif : évaluer la conformité entre la structure de la molécule "théorique" et celle synthétisée de facto par les chimistes. Des investissements lourds (RMN, spectro de masse) ont été réalisés récemment dans cette unité et constituent une des forces majeures de l'entité.
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Indispensable pour modéliser et prévoir le comportement des molécules face à leur site actif. |
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| Unité de développement chimique | Chargée de fournir les "scafold" de base permettant à la chimie médicinale d'effectuer les variations autour d'un même squelette, de fournir aux services impliqués métabolites et comparateurs, de travailler de nouvelles voies de synthèse permettant de re-préparer les quantités suffisantes (jusqu'à 250 g) des molécules entrant en pré-clinique. | ||
| Unité de biotechnologie |
Composée du service d'expression des gènes et de celui de la production de protéines. Son activité consiste en la production, la purification et l'analyse des protéines obtenues par culture de cellules animales ou fermentation de micro organismes. Les protéines obtenues sont utilisées comme cibles dans les unités HTS et anti-infectieux ainsi que pour les études de cristallographie. Un de ses atouts majeurs est son savoir-faire en chromatographie préparative, s'étendant du milligramme à plusieurs grammes de protéines.
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| fonctions centrales | Cet ensemble regroupe le HTS, plus particulièrement spécialisé sur le Profiling (criblage ciblé spécifique), la biophysique et l'analyse bio-structurale et les bio-statistiques. |
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